不知道題主想讓推薦的是TV動畫還是動畫電影，TV動畫的話這個每部都相差不多，推薦從初代開始看，然後詳細地為你推薦一下動畫電影。精靈寶可夢每年都會推出一部電影動畫，也就是劇場版動畫，其中不乏十分精彩的內容，比起TV動畫來，劇場版動畫的戰鬥場面會更加宏大，大多脫離了普通神奇寶貝之間的競技場決鬥，而是變成了以城市為舞臺的神獸大戰，到今年為止已經陸陸續續推出了20部動畫電影，接下來就為大家推薦其中幾部非常精彩的吧！
首先是1998年的《超夢的逆襲》，這也是第一部精靈寶可夢動畫電影，講述了超夢從誕生到覺醒的故事，超夢誕生自夢幻睫毛化石中提取的基因，經由火箭隊的科研員創造而成，剛出生的超夢甚至連自己是誰都不知道，他對周遭的一切都很迷茫，它認為這一切都是人類造成的，因此充滿了恨意。超夢將小智等一些有潛力的訓練家騙到了一座島上，將它們的寶可夢進行復制，最終在和夢幻的決戰下了解了生命的意義，和寶可夢們前往了其他的地方生活，這部動畫電影的優點在於戰鬥方面沒有技能限制，比起之後的作品不死板，非常值得一看。
1999年的《幻之寶可夢 洛奇亞爆誕》，這部動畫電影講述了小智等人在橘子群島冒險時的故事，他們遇到了一個自稱寶可夢收藏家的反派，它利用自己的高科技將傳說中的寶可夢閃電鳥和火焰鳥抓了起來，雖然經過小智等人的努力，將兩隻傳說寶可夢救了出來，但卻觸犯了它們的逆鱗，三隻聖鳥互相為戰，肆意破壞，使全世界的天氣陷入了混亂之中，最後在小智和洛奇亞的配合下平息了它們的憤怒，這部動畫電影也同樣精彩。
2005年的《夢幻與波導的勇者 路卡利歐》，這部動畫電影有夢幻及傳說中的三神柱登場，但真正的主角是能掌握波導之力的路卡利歐。路卡利歐從過去而來，他不明白自己的主人亞朗為什麼背棄了王國，在和小智一起前往世界初始之樹時，它透過時間之花看到了過去的真相，明白了亞朗以一己之力平息了戰鬥，於是將自己的最後用盡了最後一點力量，化為了煙塵，這部動畫電影非常令人感動。
說了幾部比較老的，再為大家推薦一部近些年的，2015年的動畫電影《光輪的超魔神 胡帕》，這部電影的精彩部分是大量神獸的曠世大戰，主角寶可夢胡帕擁有的光輪具有穿越時空的能力，能夠將遠在天邊的傳說寶可夢傳送過來，還能控制它們，在這部劇場版中出現了包括阿爾宙斯、洛奇亞、酋雷姆在內的十五隻神獸，戰鬥場面非常精彩。